如果你的电动自行车合格证丢失了，你可以按照以下步骤进行操作：
1. 首先，你需要去购买电动自行车的商家或者经销商那里查询原始的销售发票和合格证存根。这些文件上通常会有产品的详细信息，包括品牌、型号、出厂日期等。如果商家还有备份的话，他们可能会给你提供复印件。
2. 如果你的电动车是在私人手中购买的，那么你可能需要找到卖方并请求他们协助你获取相关的证明文件。
3. 如果你已经无法联系到原卖方，或者原卖方也无法提供相关文件，那么你还可以尝试联系生产厂家，看看他们是否可以提供相关信息。
4. 在以上方法都无法解决问题的情况下，你还可以向当地的消费者协会或工商部门投诉，寻求他们的帮助和支持。
5. 最后，你也可以考虑向当地的车管所咨询相关问题，看看是否有其他解决方案。
需要注意的是，以上建议仅供参考，具体操作还需根据当地的政策法规来进行。建议你先去当地的车管所进行咨询，了解具体的办理流程和所需材料。