汽车玻璃被石子磕出小点，通常是由于高速行驶中石子撞击造成的。这种损伤虽然不影响行车安全，但可能会影响美观。以下是一些建议来修复这种问题：
1. 更换玻璃：如果损伤严重或影响视线，最好的方法是更换新的玻璃。这可能需要去专业的汽车玻璃店或者4S店进行操作。
2. 喷漆修复：对于较小的损伤，可以尝试使用汽车喷漆进行修复。首先需要清洁受损区域，然后涂抹适当的底漆，最后用细喷漆喷涂覆盖。在喷涂过程中要确保颜色和透明度与周围玻璃相匹配。完成后需要在阴凉处晾干一段时间。
3. 贴膜：购买一款与车辆玻璃颜色相近的贴膜，将其剪成适当大小并贴在受损区域。这种方法简单易行，但可能不是长久之计，因为贴膜可能会脱落或老化。
请注意，以上方法仅适用于轻微损伤且不影响视线的情形。如果损伤严重或影响安全，请及时到专业维修点进行维修。