是的，有区别。
1. 成分不同：水箱里的水主要是由氢、氧两种元素组成的，而防冻液则是由乙二醇或丙二醇等化学合成的一种液体，其主要成分是醇类化合物。
2. 功能不同：水箱里的水主要起到散热降温的作用，而防冻液除了具有冷却作用外，还具有防冻、防沸、防水垢等功能。
3. 温度范围不同：水箱里的水在低温时容易结冰，导致水管破裂，而防冻液在低温时不会结冰，可以保证汽车在严寒环境下正常行驶。
4. 防腐性能不同：水箱里的水容易与金属产生化学反应生成水垢和锈迹，影响冷却效果，而防冻液具有良好的防腐性能，可以有效防止水垢和锈迹的产生。
5. 环保性不同：水箱里的水含有矿物质，长期使用会产生水垢，需要定期更换，而防冻液则不含矿物质，对环境无污染。