是的，水箱开锅（过热）会对发动机造成损害。当发动机的水箱温度过高时，可能会导致以下问题：
1. 发动机过热保护启动，导致发动机熄火或限制功率输出，影响驾驶安全。
2. 高温可能导致发动机内部运动部件的磨损加剧，如活塞、活塞环、气门等，从而缩短发动机的使用寿命。
3. 高温还可能引起橡胶件和塑料件的过早老化和损坏，如皮带、密封圈等。
4. 长期的高温可能导致发动机内部的金属材料疲劳，形成裂纹甚至破裂。
5. 严重的水箱开锅还可能导致发动机的零部件熔化或燃烧，引发安全事故。
因此，一旦发现水箱开锅现象，应立即停车并检查冷却系统，确保发动机在正常的工作温度下运行。