在武汉，机动车登记证书丢失的话需要按照以下步骤进行补办：
1. 首先到武汉市任意一个车管所服务窗口咨询并领取《机动车牌证申请表》。
2. 在表格中填写车辆的相关信息以及个人相关信息（车主姓名、身份证号等）。
3. 准备以下材料：
- 车主的身份证明原件及复印件； - 车辆的购车发票原件及复印件； - 车辆的交强险保单原件及复印件； - 车辆的出厂合格证明或进口凭证原件及复印件； - 如果车辆是单位所有的，还需要提供单位的组织机构代码证原件及复印件和委托书。
4. 将以上材料提交给车管所的服务窗口进行审核。
5. 审核通过后，车管所会通知你领取新的机动车登记证书。
6. 领取新证时，需要携带《机动车行驶证》原件。
注意：以上流程可能会因为各地具体规定有所不同而有所差异，建议提前拨打当地车管所电话咨询确认。