次氯酸本身的毒性并不大，但它的前体物质——氯气（Cl2）是一种有毒气体。在氯气和水的反应中，会生成次氯酸。
氯气是一种黄绿色的刺激性气体，具有窒息性和刺激性气味。它可以通过呼吸道进入人体，对上呼吸道、眼睛和皮肤有强烈的刺激作用。高浓度氯气可以引起中毒，表现为呼吸道炎症、肺水肿、肺炎等。严重者可发生肺纤维化，甚至致死。
而次氯酸则是一种弱酸，具有一定的氧化性，但毒性较低。它可以杀灭微生物，如细菌、病毒和寄生虫等。然而，如果直接使用高浓度的次氯酸，也可能对人体产生一定的刺激作用。因此，在使用次氯酸产品时，应遵循安全操作规程，避免直接接触皮肤和眼睛。