1. 柴油发动机进水后，首先会导致发动机无法正常工作。因为水不能替代燃油在发动机内燃烧，而且水的密度比柴油大，进入气缸后会阻碍活塞运动，导致发动机熄火。
2. 由于水无法完全燃烧，会残留在发动机内部，与机油混合，导致机油变质，影响发动机润滑效果，进一步加剧发动机部件的磨损和损坏。
3. 水分可能进入油泵、喷油器等重要部件，造成这些部件的损坏或失效。
4. 水分还可能进入排气系统，导致三元催化器等排放控制装置失效，甚至严重损坏。
5. 长时间不处理发动机进水的问题，可能导致发动机内部锈蚀，进一步恶化发动机的性能和寿命。