无论是去4S店还是修理店进行补漆，都有可能出现色差。这是因为汽车喷漆是由多层油漆组成的，每一层的颜色都可能略有不同。如果补漆时没有完全匹配原车的油漆层数或者油漆质量不佳，就可能导致色差的出现。
如果你选择去4S店补漆，他们通常会使用原厂油漆，并且有专业的喷漆设备和技术人员，因此色差的可能性相对较小。但是价格可能会比较高。
如果你在修理店补漆，虽然价格可能更便宜，但是由于油漆质量和喷漆设备的差异，可能会出现色差。而且，如果修补后的油漆部分与整车油漆存在明显差异，可能会影响车辆的美观和价值。
总的来说，如果你想避免色差，最好选择去4S店进行补漆。但是，如果你只是需要小范围的修补，那么去一家信誉良好的修理店也是可以的。