摩托车排气管生锈的原因主要有以下几点：
1. 环境因素：排气管在长时间的使用过程中，会接触到空气中的水分和氧气，再加上排气管表面可能存在的油污等杂质，为锈蚀微生物的滋生提供了条件。因此，排气管容易受到大气环境的侵蚀而发生锈蚀。
2. 材质问题：如果排气管的材质本身抗腐蚀性能较差，或者经过长时间的磨损后，表面的防锈处理层被磨掉，那么排气管就更容易生锈了。
3. 使用不当：如果摩托车在使用过程中，经常处于潮湿、高温或者有盐雾的环境中，也会加速排气管的锈蚀过程。此外，如果车主没有及时对摩托车进行定期的保养和维护，如清洗、涂油等，也会导致排气管过早地出现锈蚀现象。