摩托车的发动机故障指示灯亮起通常表示发动机或相关的系统出现了一些问题。以下是一些可能的原因：
1. 燃油系统问题：可能是燃油泵、喷油器、燃油滤清器等部件出现故障，导致燃油供应出现问题。
2. 点火系统问题：可能是火花塞、点火线圈、点火开关等部件出现故障，导致点火系统无法正常工作。
3. 空气进气系统问题：可能是空气滤清器堵塞或者进气道漏气等问题，导致发动机吸入的空气量不足。
4. 机油压力过低：可能是机油泵、机油滤清器、油压传感器等部件出现故障，导致机油压力低于正常值。
5. 发动机过热：可能是冷却系统出现问题，如冷却液泄漏、水泵故障、散热器堵塞等，导致发动机温度过高。
6. 传感器故障：可能是发动机的某些传感器（如氧传感器、曲轴位置传感器等）出现故障，导致发动机控制单元无法正确识别发动机的工作状态。
7. 发动机控制单元故障：可能是发动机的控制单元（ECU）出现故障，导致发动机无法正常工作。
当发动机故障指示灯亮起时，应立即停车检查并找出问题所在。如果继续行驶可能会导致发动机严重损坏。如果找不到具体原因，建议去专业的摩托车维修店进行检查和维修。