摩托车在停车后自动熄火的原因可能有以下几点：
1. 燃油系统问题：可能是燃油泵、化油器或喷油嘴等部件出现故障，导致燃油供应不足。
2. 点火系统问题：可能是火花塞、点火线圈或磁电机等部件出现问题，导致点火系统失效。
3. 电气系统问题：可能是电瓶电量不足或者电路接触不良等问题导致的熄火。
4. 机械故障：发动机的活塞、气门、曲轴等关键部件磨损严重或出现故障，可能导致发动机无法正常工作。
5. 怠速系统问题：可能是怠速马达、节气门或者空气进气系统出现故障，导致发动机无法保持稳定的怠速运行。
以上都是可能的原因，具体需要根据摩托车的实际情况进行检查和维修。