更换发动机的车辆在进行年检时，需要提供一些额外的材料。具体包括：
1. 车主身份证原件及复印件； 2. 车辆行驶证原件及复印件； 3. 机动车登记证书原件及复印件； 4. 车辆技术参数表（车辆出厂合格证）原件及复印件； 5. 更换发动机的发票及工单原件及复印件； 6. 环保信息登记表； 7. 环保检验合格证明； 8. 车辆外观照片等。
以上材料提交给当地的车辆检测站后，检测站会对车辆进行全面的检查，包括发动机的性能、排放、噪音等方面。如果检查结果符合国家的排放标准和安全标准，那么车辆就可以通过年检并获得年检标志。否则，车辆将无法通过年检。