这两家公司都是中国知名的制药企业，各有其优势。比较它们的实力需要考虑多个因素，如市值、盈利能力、研发投入等。
截至2021年9月30日，上海医药的总市值约为1486亿元人民币，而恒瑞医药的总市值约为5187亿元人民币。从市值上看，恒瑞医药明显高于上海医药。
在盈利能力方面，由于两家公司的财务报告并未公布2021年的数据，我们只能参考过去几年的数据。根据2019年和2020年的年报数据显示，恒瑞医药的净利润分别为53.3亿元和40.8亿元，而上海医药的净利润分别为13.7亿元和11.4亿元。可以看出，恒瑞医药的盈利能力也优于上海医药。
在研发投入上，恒瑞医药近年来一直保持着较高的投入，2020年的研发投入为39亿元，占营收比重达到18.7%；而上海医药的研发投入相对较低，2020年的研发投入为11.3亿元，占营收比重仅为6.6%。
综合来看，虽然上海医药在市值上略高于恒瑞医药，但在其他方面如盈利能力和研发投入等方面，恒瑞医药的表现更为优秀。因此，可以说恒瑞医药的整体实力更强一些。