奔驰GLS和北京BJ90的主要区别在于以下几个方面：
1. 品牌：奔驰GLS属于梅赛德斯-奔驰品牌，而北京BJ90属于北汽集团旗下北京品牌。
2. 价格：奔驰GLS的指导价为109.38-139.7万元，而北京BJ90的指导价为47.8-49.8万元，前者价格更高。
3. 内饰：奔驰GLS的座椅材质为真皮，配备可开启全景天窗，第一排座椅具有加热和通风功能。而北京BJ90的座椅材质也是真皮，配备分段式电动天窗，第一排座椅仅具有加热功能。
4. 市场表现：虽然奔驰GLS没有具体销量数据，但其日均关注度较高，达到37685，而北京BJ90的销量为3409辆，日均关注度为7193。
5. 空间：奔驰GLS的车身尺寸为5210*2030*1838，轴距为3135，座位数为7个。北京BJ90的车身尺寸为5171*1995*1902，轴距为3100，座位数为5个。在车身长度、宽度和轴距上，奔驰GLS略胜一筹。
6. 动力：两款车型都使用手自一体（AT）变速箱，但奔驰GLS搭载的是3.0T 380马力L6发动机，最大速度为246km/h；北京BJ90则搭载3.0T 333马力V6发动机，最大速度为245km/h。在马力、扭矩和最大速度方面，奔驰GLS略占优势。
总的来说，奔驰GLS在北京BJ90的基础上，提供了更高的价格、更豪华的内饰、更好的市场表现、更大的空间和更强的动力。然而，这两款车的定位和市场策略有所不同，消费者可以根据自己的需求和预算来选择合适的车型。