外地车申请深圳一天免限行被拒绝的原因可能有以下几点：
1. 申请时间不符合规定。深圳限行的规定是工作日，非粤B车牌的车辆在早晚高峰期（7:00-9:00,17:30-19:30）需要在限行区域内行驶的需要申请免限行。如果是在周末或者法定节假日申请的，会被拒绝。
2. 申请材料不齐全或不准确。需要提供有效的驾驶证、行驶证、身份证等材料，材料不齐全或信息不准确也会影响申请结果。
3. 车辆存在违法行为未处理。如果车辆有未处理的交通违法记录，也是无法通过申请的。
4. 系统故障或其他原因。有时候，由于系统故障或者其他原因，也会导致申请失败。
为了避免申请被拒，建议提前准备好相关材料，确保信息准确无误，并在规定的时间内提交申请。