办理农村客运资格证的流程如下：
1. 首先，你需要具备B2及以上驾驶证。这是驾驶农村客运车辆的基本要求。
2. 然后，你需要到当地的运管部门（运输管理局）报名，参加道路运输从业人员资格考试。这个考试主要测试你的交通安全法规、职业道德等方面的知识和技能。
3. 在通过考试后，你会获得《道路运输从业人员从业资格证》。这个证书是证明你具备从事道路运输行业资格的有效证件。
4. 接下来，你需要到当地的交通管理部门（运输管理局）申请道路客运班线经营许可。提交相关材料，包括营业执照、道路运输经营许可证等。
5. 审核通过后，你将获得《道路客运班线经营许可证明》。这个证明是你合法经营农村客运业务的依据。
6. 最后，你需要购买符合标准的农村客运车辆，并到当地的车辆检测部门进行车辆检测，确保车辆安全性能符合标准。
7. 一切准备就绪后，你就可以开始运营农村客运业务了。
需要注意的是，以上流程可能因地区而异，具体操作流程请咨询当地相关部门。