处理公司车辆的违章扣分，首先需要了解当地的交通法规和相关规定。以下是一些建议：
1. 了解规定：仔细阅读当地交通管理部门的规定和政策，确保你了解如何处理违章行为以及可能的处罚措施。
2. 查询违章记录：通过相关网站或手机APP查询你的车辆是否有违章记录。如果发现有违章行为，需要及时处理。
3. 处理违章：携带相关证件（如驾驶证、行驶证等）到指定地点缴纳罚款并处理扣分。如果你不熟悉流程，可以请教专业人士或者请一位代表帮你办理。
4. 学习经验：分析违章原因，加强员工交通安全教育，提高员工的交通安全意识，避免类似问题再次发生。
5. 考虑使用第三方服务：有些地区提供第三方服务来帮助处理违章行为，例如代办服务等。你可以咨询一下当地的情况，看看是否可以使用这些服务来帮助你解决问题。
6. 如果扣分过多，可以考虑找有驾照的同事帮忙消分。但是要注意，这种行为可能涉及到违法，所以要确保你了解的法律规定并遵守它们。