在进行公司车辆的年检时，需要准备以下材料：
1. 《机动车检验标志申请表》（可在车管所官网下载或到车管所领取）； 2. 行驶证原件及复印件； 3. 交强险保险凭证原件及复印件； 4. 车船税纳税或者免税证明原件及复印件（如需缴纳车船税）； 5. 车主身份证原件及复印件（如果是单位的车辆，需提供组织机构代码证原件及复印件和代办人的身份证明原件及复印件）； 6. 车辆登记证书原件及复印件； 7. 若车辆有违章记录未处理，需携带交通违章罚款收据。
以上材料准备好后，可以前往杭州市车管所或其指定的检测站进行年检。具体地址和联系方式可以在网上查询或电话咨询。