交警扣掉的摩托车会按照以下步骤进行处理：
1. 登记保存。交警会对被扣押的摩托车进行登记，记录摩托车的品牌、型号、颜色等信息。同时，交警还会对驾驶者的信息进行记录。
2. 调查。交警会对摩托车的来源和使用情况进行调查，以确定是否存在违法行为或不符合交通法规的情况。这可能需要一些时间，因为需要核实和查证相关信息。
3. 依法处理。如果调查发现摩托车存在违法行为或者不符合交通法规要求，交警会根据相关法律法规进行处罚。处罚方式可能包括罚款、吊销驾照、没收摩托车等。
4. 归还。如果摩托车没有违法行为，或者已经接受了相应的处罚，那么交警会在一定时间内将摩托车归还给车主。
需要注意的是，这个过程可能会因地区和具体情况而有所不同。如果你对自己的摩托车被扣押有疑问，应该及时联系当地的交通管理部门了解更多信息。