车牌上的字母“E”代表的是云南省的第二个地区，即“昭通市”。
根据《中华人民共和国机动车号牌》的规定，车牌号由汉字、英文字母和阿拉伯数字组成，其含义如下：
1. 汉字：代表该车所在地的省会城市或地级市，如“云A”代表云南省昆明市，“云C”代表云南省曲靖市等； 2. 英文字母：代表该车所在地所在的地级行政区，为该车登记所在地的地名拼音首位字母，从“A”到“Z”的任意一个字母，如果某地区需要使用字母“I”和“O”，则分别用“V”和“U”代替； 3. 阿拉伯数字：代表该车在该地序列号，一般为5位数字，若车牌号不够使用，可以在前面加“0”补足至5位。
所以，云E代表的是云南省昭通市的汽车牌照。