1. 易漏水：天窗在使用过程中，如果密封圈老化或者损坏，就容易发生漏水现象。一旦车内进水，不仅会影响车内环境，还可能对电子设备和内饰造成损害。
2. 增加重量：天窗会增加车辆的重量，从而影响燃油效率。对于注重节能的车主来说，这是一个需要考虑的因素。
3. 维修成本高：天窗如果出现故障，维修成本相对较高。而且天窗的使用寿命通常不如车身其他部分长，更换天窗也需要一笔不小的费用。
4. 安全隐患：天窗在行驶过程中可能会因为震动或意外导致破裂，给驾驶员和乘客带来安全隐患。此外，天窗也可能成为盗贼的目标，给车辆安全带来威胁。
5. 增加噪音：天窗在高速行驶时，风噪会明显增大，影响车内舒适度。
6. 热胀冷缩问题：天窗在夏季接受阳光直射时，车内部件容易受热变形；而在冬季，天窗可能因为车内外的温差而出现结霜、结冰等现象，给使用带来不便。