在上海，以下情况可以申请限行区通行证：
1. 本市户籍居民因家庭成员有重大疾病、危重病情或者紧急突发事件需要使用本市非营运性质小客车，可以申请限行区通行证。
2. 持有上海市公安部门核发的有效证件的外籍人员，以及港澳台地区居民和外国人，因本人在沪居住、工作和生活需要使用非营运性质小客车，可以申请限行区通行证。
3. 企事业单位、社会团体等非本市户籍人员因公务、商务等活动需要使用非营运性质小客车，可以申请限行区通行证。
4. 持有有效机动车驾驶证的残疾人，可以驾驶本人名下的小型自动挡载客汽车，申请限行区通行证。
5. 本市户籍居民或持有上海市公安部门核发的有效证件的外籍人员、港澳台地区居民和外国人，因应急抢险、救援等公共利益需要使用非营运性质小客车，可以申请限行区通行证。
申请流程如下：
1. 准备相关材料，如身份证明、驾驶证、车辆行驶证、相关证明文件等。
2. 前往上海市公安局交通警察总队车辆管理所或其指定的办理地点进行申请。
3. 提交申请材料，工作人员会对材料进行审核。
4. 审核通过后，领取限行区通行证。
需要注意的是，限行区通行证有效期一般为一个月，且每个账号只能申请一次。