1. 稳定性差：由于三缸发动机的物理结构原因，其运行过程中会产生比四缸更多的震动。虽然现代制造工艺已经大大减少了这种震动的传递，但在行驶中仍然可能会感觉到明显的抖动，影响驾驶体验和车辆的耐用性。
2. 噪音大：同样因为三缸发动机的结构问题，在运行过程中会产生较大的噪音。这不仅会降低驾驶员和乘客的舒适度，还可能对车辆的外部隔音造成损害。
3. 油耗高：尽管三缸发动机在排量相同的情况下，理论上应该比四缸发动机更省油。但由于上述提到的震动和噪音问题，实际使用中，三缸车的油耗表现往往不如预期。
4. 维修成本高：由于三缸机相对较少，配件供应可能没有四缸机那么充足，一旦出现故障，维修成本可能会更高。
5. 二手价值低：由于以上各种原因，三缸车的性能、稳定性和舒适性都相对较差，因此在二手车市场上，三缸车的价格通常会比同等条件下的四缸车更低。