1. 抖动问题：由于三缸发动机的物理特性，其在运行过程中会产生一定的抖动。虽然现代制造工艺已经大大减轻了这种抖动，但在行驶过程中还是能感觉到一定程度的抖动，影响驾驶体验。
2. 噪音问题：三缸发动机在运行时，由于活塞运动的特殊性，会产生较大的噪音。这种噪音在车内较为明显，影响乘坐舒适度。
3. 维修成本：由于三缸发动机的结构相对简单，因此在维修时的零部件也相对较少，这可能导致维修成本的增加。
4. 燃油经济性：虽然三缸发动机在结构上相较于四缸发动机更加紧凑，但是在燃油经济性方面并没有明显的优势。
5. 保值率：由于上述原因，购买三缸车的消费者可能会更倾向于选择其他品牌或车型，因此三缸车在二手车市场上的保值率相对较低。