对于公司车辆违章的处理，首先需要了解具体违章情况。如果是现场违章停车处罚，驾驶人在场的，交警可以指出违法行为，并予以口头警告，令驾驶人立即驶离。如果驾驶人拒绝驶离，驾驶的车辆妨碍其他车辆、行人通行的，交警会对你处以二十元以上二百元以下罚款。如果驾驶人不在场，交警部门有权将该机动车拖移至不妨碍交通的地点或者公安机关交通管理部门指定的地点停放。
对于非现场违章停车处罚，交警部门会对违法车辆进行拍照取证，并对违法驾驶人进行罚款处罚。罚款金额会根据违章行为的严重程度来确定。
处理违章的方法是，携带相关证件和车辆行驶证，到达交警部门后，把违法停车处理告知单交给工作人员，然后工作人员会核实罚款数额，是否扣分（违法停车不扣分），然后受理罚款申请，然后会给你交费名称，接着去银行交费即可。也可以通过网络银行或者电子银行缴纳罚款。
总之，公司车辆违章的处理需要根据具体的违章情况进行，按照相关法律规定进行处理，并确保违章行为得到及时纠正。