车船税发票遗失的补办方法：
1、纳税人的车船税完税证明如不慎遗失，可以携带身份证、行驶证到地税征收大厅进行补回；
2、车船税有发票。车船税现在是由保险公司代收，在保险发票的总金额下面的地方是有注明的，税务是认可的；
3、自2016年5月1日起，保险机构作为车船税扣缴义务人在开具增值税发票时，应在增值税发票备注栏中注明代收车船税税款信息；