启停系统故障发动机故障灯亮的原因如下：
1、发动机自动启停技术是应城市交通拥堵的路况而产生的；
2、市区行车，难免走走停停，车辆怠速时发动机空转运行不仅会耗费燃油，且产生的尾气也不利于城市环境；
3、通过发动机自动启停技术，驾驶员只要踩住制动踏板使车辆停住，自动启停系统便会控制发动机自动熄火，在释放制动踏板后，脚踩油门，发动机会自动启动。