1.成本：特别是初期建制成本，还是高于发电机，所以难以推广，虽然随着技术的进步，成本也在下降，但还有一段路要走。
2.技术门槛高：对于制造者、销售者、消费者都需要有一定的技术或训练，目前还不易达到。
3.基础设施的配合：重点就是燃料的提供，不管是用天然气或石油气进行改质，或直接使用氢，都需要有配合的基础设施，又是一笔很大的支出。