在12123上处理电动车违章并缴纳罚款，对你的驾照没有影响。但是需要注意的是，如果你的违章行为涉及到扣分的，那么扣分是会影响到你的驾驶证的。
具体步骤如下：
1. 打开12123应用或网站。
2. 登录你的账号。
3. 在主界面找到“未处交通违法”或者“待缴费”选项点击进入。
4. 查看你所有的未处理的违法记录，包括罚款和扣分情况。
5. 选择你要处理的违法记录点击处理，然后按照提示操作即可完成支付。
注意：在处理违章时，你需要确保你的驾驶证分数足够抵扣这次违章所扣的分数。如果不够的话，你可能需要等到下一个记分周期才能处理这个违章。