这两款车都是顶级性能的摩托车，各有优势。选择哪款主要取决于你的需求和喜好。
如果你更看重操控性、驾驶体验以及德国制造的品质，那么宝马S1000RR可能是更好的选择。它的悬挂系统、刹车系统和电子控制系统都非常出色，而且驾驶感受非常稳定。此外，宝马的维修保养网络也非常完善，方便你进行定期维护。
如果你喜欢日本品牌，喜欢更轻的重量和更激进的设计风格，那么川崎Ninja 10R可能更适合你。它的发动机动力输出非常强大，加速性能卓越，而且车身设计非常流线型，操控性也很好。但是，它的维修保养网络相对较少，可能需要更多的自主维护能力。
总的来说，这两款车型都是非常出色的，你可以根据自己的需求来选择。