作为一个大语言模型，我无法提供具体的法律建议。但是一般来说，如果公司的车辆发生了违章行为，应该按照以下步骤进行处理：
1. 确认违章情况：首先需要确认车辆的违章记录，可以通过交通部门的网站或者APP进行查询。
2. 处理违章：如果确认了违章情况，需要按照交通部门的规定进行处理，例如缴纳罚款、扣分等。
3. 记录和报告：在处理完违章后，需要将违章情况和处理结果记录下来，并向公司进行报告。
4. 预防措施：为了防止类似的情况再次发生，可以采取一些措施，例如加强驾驶员的培训和教育，加强对车辆的维护和管理等。