1. 控制方式：自动空调系统可以自动调节车内温度，而手动空调需要驾驶员自己调整。
2. 舒适性：自动空调系统可以根据车辆内外部的环境自动调节出风口温度和风速，使乘客感到更加舒适；而手动空调则需要驾驶员根据乘客的需求进行调整，可能无法满足所有乘客的舒适度需求。
3. 节能性：自动空调系统可以根据车辆行驶速度和载重情况自动调整空调工作状态，从而提高能源利用效率；而手动空调则无法实现这一功能，可能导致能源浪费。
4. 安全性：自动空调系统可以在紧急情况下自动关闭空调系统，确保行车安全；而手动空调则需要在驾驶员手动操作的情况下才能关闭空调系统。