在厦门市为电动自行车上牌的流程如下：
1. 准备材料：身份证、购车发票或收据、车辆合格证。
2. 填写申请表：到车管所领取并填写《电动自行车登记申请表》，或者在网上下载表格并打印出来。
3. 提交申请：将上述材料带到车管所，提交申请。工作人员会对车辆进行检查，检查内容包括车辆的品牌、型号、整车质量、外形尺寸等是否与合格证相符；是否有脚踏骑行设备；车辆的颜色是否与合格证上的一致等。
4. 缴纳费用：根据规定，电动自行车上牌需要交纳一定的工本费。
5. 领取牌照：审核通过后，车主就可以领取电动自行车牌照了。
6. 安装牌照：将牌照固定在车辆的前面或者后面，保持清晰可辨。
注意：不同地方的具体操作可能会有所不同，建议提前咨询当地的车管所了解最新的政策和办理流程。