在汽车领域中，BJ40柴油版的缺点主要包括以下几点：
1. 燃油经济性：相较于汽油版车型，柴油版车型在燃油经济性方面可能略逊一筹。虽然柴油发动机的热效率较高，但在城市驾驶过程中，频繁的启停和低速行驶可能导致油耗增加。
2. 噪音：柴油发动机在运行过程中产生的噪音相对较大，可能会影响到驾驶员和乘客的舒适度。
3. 维护成本：柴油发动机的维护成本相对较高，包括滤清器、油液等方面的更换频率和价格都可能高于汽油发动机。
4. 市场接受度：虽然柴油版车型在节油性能上具有优势，但在国内市场上，消费者对柴油车的认知和接受程度相对较低，这可能影响到BJ40柴油版的销售表现。