高速超时费应该是根据以下方式收取的：
1、比如一段路长60公里，那么就必须在一小时内行驶完，如果超过一小时，那么每小时就要收取40元的超时费，但是不同的地方收费标准都不同；
2、高速超时费主要是为了避免有人使用废卡逃避通行费，现在这种费用仍然还会收的；
3、所以在服务区休息时，要食宿费用的发票等，以便在出口付款超时的情况下，可以使用这些发票作为凭证。